Кафедра была основана в 1994 году. Заведующим кафедрой  назначен к.м.н. Муродов Т.Р. Ассистенты кафедры Рахматов Ю.К., Бозоров Е., Саидов Г.С., Остонов О.Р., Сайфуллаев Н.Ю., Давлатов С., Саидов С.С., Шарипова М.М. В соответствии с приказом № 4173 от 1997 года заведующим кафедрой был доктор медицинских наук, профессор Омиров Рауф Юлдашевич.

Доцент кафедры, к.м.н. Уроков Ш.Т., ассистенты к.м.н. Муродов Т.Р., к.м.н. Саидов С.С., к.м.д. Абдурахманов М.М. и аспирант кафедры Абидов У.О. Лекции, научные труды профессора Омирова Рауфа Юлдашевича навсегда остались в сердцах студентов и коллег. Он возглавлял кафедру до 2005 года и был вынужден оставить свою работу и исследования по состоянию здоровья. За эти годы сотрудники кафедры и кафедры усилили свой экспериментальный и педагогический потенциал. Профессор Омиров Р.Ю. выполнял многочисленные, сложнейшие операции, спасая жизни пациентов. Под его руководством были успешно защищены 4 кандидатские и 1 докторские диссертации.   

С 2005 года заведующим кафедрой является д.м.н. Ураков Шухрат Тухтаевич.

В 2007 году кафедра хирургических болезней 6-7 курсов была объединена с кафедрой детской хирургии.

С 2015-2016 по 2016-2017 учебный год в состав кафедры включен курс «Онкология, радиология и терапия». Кафедра называлась «Хирургические заболевания, детская хирургия, онкология, лучевая диагностика и терапия».

Отделение переименовано в «Хирургические заболевания и реанимация» с 2017 года. Кафедра «Хирургические заболевания и реанимация» находится в Бухарском филиале РНЦЭМП и сотрудничает с такими отделениями как: приемный покой, шок-зал, I-II хирургические отделения, общая реанимация, нейрореанимация, кардиотерапевтическая и детская реанимации.

Сотрудниками кафедры являются: заведующий кафедрой д.м.н. Уроков Ш.Т., профессор кафедры, д.м.н. Абдурахманов М.М., доцент кафедры, к.м.н. Эшонов О.Ш., к.м.н. Абидов У.О., к.м.н. Абдурахманов Ш.М., к.м.н. Чулиев А.Т., PhD Абдурахманов З.М.,  ассистент Болтаев Э.Б., докторант Пулатова Ш.Х., ассистент Ризаева М.Ж., ассистент Исомитдинов Б.Ш., ассистент Хайитов Д.Х., ассистент Кайимов М.Т.

Обучение на кафедре проводится в залах, оснащенных высокотехнологичным учебным оборудованием. В каждой аудитории  имеется компьютер и современные технологии, все необходимые условия для использования электронной библиотеки и модулей. Кроме того, в лекционном зале имеется Smart board,  проектор для обучения мультимедиа, сканер, камера и видеокамера, которые можно использовать для создания раздаточных материалов для дальнейшего расширения практических занятий. Более 100 лекций, записанных на компакт-диск 3D-дисками DVD с практической иллюстрацией и операциями.

Сотрудники кафедры регулярно участвуют в научных, практических конференциях и форумах в республике и мире. На сайте, где у кафедры есть собственный сайт, постоянно публикуются новости о научно-образовательном процессе. В настоящее время кафедра «Хирургические болезни и реанимации» является одной из ведущих кафедр института.

Основной целью кафедры является обеспечение высококлассных врачей по Бухарской области и соседних регионах. В настоящее время отделение находится в Бухарском филиале Республиканского научного центра экстренной медицинской помощи. На кафедре обучаются 14 магистрантов и 30 клинических ординаторов.