Бухарский государственный медицинский институт был основан в октябре 1990 года. В марте 1991 года по решению Президиума Бухарского областного Совета народных депутатов ему было присвоено имя Абу Али ибн Сино.

Медицинский факультет был открыт в 1991 году, стоматологический — в 1992 году, отделение высококвалифицированных медсестёр — в 1999 году, факультет медицинской педагогики — в 2001 году, педиатрический факультет — в 2016 году. С 2018 года открыты два новых направления — медицинская профилактика и медицинская биология.

В настоящее время в институте функционируют:

• 4 факультета;

• 53 кафедры;

• 9 направлений бакалавриата;

• 30 специальностей магистратуры;

• более 36 направлений клинической ординатуры;

• 20 совместных двудипломных программ на всех трех уровнях образования.

Общее количество студентов и клинических ординаторов превышает 9180 человек.

Преподавательский состав включает:

• 648 преподавателей;

• из них 97 докторов наук и профессоров;

• 253 кандидата наук (PhD) и доцента;

• 100 старших преподавателей и ассистентов.

Обучение ведется на узбекском, русском, английском и турецком языках.

Институт готовит специалистов по следующим 9 направлениям и одной международной программе:

1. Лечебное дело – 6 лет

2. Медико-педагогическая работа – 6 лет

3. Педиатрия – 6 лет

4. Стоматология – 5 лет

5. Медицинская профилактика – 5 лет

6. Медицинская биология – 4 года

7. Высшее сестринское дело – 4 года

8. Народная медицина – 4 года

9. Фармация – 5 лет